由於交通發展便利、世界各地旅客往來頻繁，近年來生物性因素引起之疾病型態愈發多元化，加上微生物基因產生突變、對控制藥物產生抗藥性，對社會的衝擊也愈來愈大。例如:1998年台灣爆發腸病毒71型（Ev-71）大流行，造成約140萬名幼童感染，其中78人死亡；2003年出現嚴重急性呼吸道症候群(SARS)，全國共有346名確診病例，造成73人死亡；2013年至2023年5月，國內新型A流感確診個案共9名，近3年為H1N2v個案皆有豬隻暴露史。又因全球氣候變遷影響昆蟲的孳生，蟲媒傳染病造成新的衝擊。臺灣過去曾於1901年、1915年、1931年及1942年發生全島性登革熱疫情，該傳染病於2015年臺南市爆發疫情，擴散至全臺灣，確診病例超過4萬人，死亡病例218人。本縣每年較易發生之傳染病主要為結核病、流感併發重症、登革熱及腸病毒等，2020年嚴重特殊傳染性肺炎興起，目前國內外疫情整體雖較前波高峰趨緩，仍需持續關注，